由于新三板的業(yè)務(wù)規(guī)則與上市公司交易規(guī)則有著本質(zhì)的不同，協(xié)會(huì)特別發(fā)布了名為《報(bào)價(jià)轉(zhuǎn)讓特別風(fēng)險(xiǎn)揭示書》的操作性文件，用于揭示新三板市場的特殊風(fēng)險(xiǎn)。代辦股份轉(zhuǎn)讓除了具有資本市場的普遍風(fēng)險(xiǎn)外，還需要投資者注意以下幾類風(fēng)險(xiǎn)：

　　(一)運(yùn)營風(fēng)險(xiǎn)

　　新三板掛牌公司集中于高新技術(shù)企業(yè)，技術(shù)更新較快，市場反應(yīng)靈敏，對單一技術(shù)和核心技術(shù)人員的依賴程度較高，這在本質(zhì)上決定了其變動(dòng)性較大。此外，新三板企業(yè)通常規(guī)模不大，而且其主背業(yè)務(wù)收人、營業(yè)利潤、每股凈收益等財(cái)務(wù)指標(biāo)遠(yuǎn)低于上市公司.抗市場和行業(yè)風(fēng)險(xiǎn)的能力較弱。

　　(二)信息風(fēng)險(xiǎn)

　　掛牌公司的信息披露標(biāo)準(zhǔn)低于上市公司，投資者基于披露的信息對掛牌公司了解有限。因此，投資者的投資決策不應(yīng)局限千此，而應(yīng)從各方面渠道了解公司運(yùn)營情況，以打破“信息不對稱”的局面。

　　(三)信用風(fēng)險(xiǎn)

　　雖然股份報(bào)價(jià)轉(zhuǎn)讓過程有主辦券商的督導(dǎo)和協(xié)會(huì)的監(jiān)管，但仍然無法避免中止交易的風(fēng)險(xiǎn)。影響投資者的預(yù)期收益。特別需要注意的是，股份報(bào)價(jià)轉(zhuǎn)讓并不實(shí)行擔(dān)保交收，可能因?yàn)榻灰讓κ值脑蚨鴮?dǎo)致無法完成資金交收。

　　(四)流動(dòng)性風(fēng)險(xiǎn)

　　目前新三板的投資主體數(shù)量較少，投資額也不大，掛牌公司的股份轉(zhuǎn)讓需要一定時(shí)間來消化。另外，由于股份報(bào)價(jià)轉(zhuǎn)讓需要買賣雙方自行達(dá)成轉(zhuǎn)讓協(xié)議，存在一定的議價(jià)時(shí)間，股份的交易無法在短時(shí)間內(nèi)完成。

　　可以看到，新三板的各項(xiàng)制度正在竭力降低上述風(fēng)險(xiǎn)，卻無法做到完全避免，這是由資本市場的本質(zhì)決定的，而這往往也是其魅力所在。掛牌公司作為成長期的高新技術(shù)企業(yè)，天然具有高風(fēng)險(xiǎn)、高收益的特點(diǎn)，這對投資者而言，無疑既是挑戰(zhàn)，又是機(jī)會(huì)。